При этом метановый НЕФАЗ LNG сохранил все преимущества базовой модели: низкий уровень пола, увеличенный проём средней двери, просторную накопительную площадку, систему книлинг, которая позволяет наклонять кузов автобуса для удобной посадки и высадки пассажиров. Как и базовая модель, НЕФАЗ-5299-40-57 LNG полностью соответствует программе «Доступная среда»: в автобусе установлена механическая аппарель для беспрепятственного въезда в салон маломобильных пассажиров, специальное место крепления инвалидной коляски, кнопки связи с водителем. Общая пассажировместимость 107 человек, в том числе 25 из них могут ехать сидя.
Портальный мост, независимая передняя подвеска и автоматическая коробка передач несут клеймо ZF. Газовый двигатель производства Weichai (7,5 литра, 260 л.с.). Интерес к модели проявили транспортные предприятия Челябинской области, Республики Коми и Санкт-Петербурга. В настоящее время автобус готовится для передачи в тестовую эксплуатацию в Северную столицу, после чего планируется начать его серийное производство.